Web-tools for the genomic analysis of the 2022 Monkeypox virus global outbreak / Herramientas web para el análisis genómico del virus de la viruela símica durante el brote mundial de 2022

Abstract The resources and platforms available on the internet for collecting and sharing information and performing genomic sequence analysis have made it possible to follow closely the evolution the evolution of SARS-CoV-2. However, the current monkeypox outbreak in the world brings us back to the need to use these resources to appraise the extent of this outbreak. The objective of this work was an analysis of the information presented so far in the genomic database GISAID EpiPox™, using various tools available on the web. The results indicate that the monkeypox outbreak is referred as MPXV clade II B.1 lineage and sub-lineages, isolated from male patients mainly from the European and American continents. In the current scenario, the access to genomic sequences, epidemiological information, and tools available to the scientific community is of great importance for global public health in order to follow the evolution of pathogens.

Resumen Los recursos y plataformas disponibles en Internet para recopilar, compartir información y realizar análisis de secuencias genómicas han permitido seguir de cerca la evolución del SARS-CoV-2. El actual brote global de viruela del mono en el mundo, requiere de nuevo utilizar estos recursos para conocer el alcance de este brote. El objetivo de este trabajo fue un análisis de la información presentada hasta el momento en la base de datos genómica EpiPox™ de GISAID, utilizando diversas herramientas disponibles en la web. Los resultados indican que el brote de la viruela del mono o símica está referido al linaje y sub-linajes B.1 del clado II de MPXV, aislado principalmente de pacientes hombres de Europa y América. En el escenario actual, el acceso a las secuencias genómicas, la información epidemiológica, y las herramientas disponibles para la comunidad científica son de gran importancia para la salud pública mundial con el fin de seguir la evolución de los patógenos.

Sub-lineages of the Omicron variant of SARS-CoV-2: characteristic mutations and their relation to epidemiological behavior / Sub-linajes de la variante Ómicron del SARS-CoV-2: mutaciones características y su relación con el comportamiento epidemiológico

Abstract By the end of 2021, the Omicron variant of SARS-CoV-2, the coronavirus responsible for COVID-19, emerges, causing immediate concern, due to the explosive increase in cases in South Africa and a large number of mutations. This study describes the characteristic mutations of the Omicron variant in the Spike protein, and the behavior of the successive epidemic waves associated to the sub-lineages throughout the world. The mutations in the Spike protein described are related to the virus ability to evade the protection elicited by current vaccines, as well as with possible reduced susceptibility to host proteases for priming of the fusion process, and how this might be related to changes in tropism, a replication enhanced in nasal epithelial cells, and reduced in pulmonary tissue; traits probably associated with the apparent reduced severity of Omicron compared to other variants.

Resumen A finales de 2021 surge la variante Omicron del SARS-CoV-2, el coronavirus responsable de la COVID-19, causando preocupación inmediata, debido al aumento explosivo de casos en Suráfrica, y a su gran cantidad de mutaciones. Este estudio describe las mutaciones características de la variante Ómicron en la proteína de la Espiga (S) y el comportamiento de las sucesivas olas epidémicas asociadas a la circulación de sus sub-linajes en todo el mundo. Las mutaciones en la proteína S descritas están relacionadas con su capacidad para evadir la protección provocada por las vacunas actuales, así como su posible susceptibilidad reducida a las proteasas del hospedero para la preparación del proceso de fusión. Se infiere cómo esto podría estar relacionado con su cambio en el tropismo, con una replicación mayor en las células epiteliales nasales y menor en el tejido pulmonar, rasgos probablemente asociados a su aparente menor gravedad en comparación con otras variantes.

Impacto de los determinantes sociales de la salud sobre la tasa de contagios por COVID-19 / Impact of the social determinants of health on the rate of infections by COVID-19

RESUMEN Objetivo Analizar el impacto entre los determinantes sociales en salud en México y la tasa de contagios por COVID-19. Método Estudio ecológico cuantitativo a nivel nacional y municipal. Las principales variables fueron tasa de contagios por COVID-19, población total no hablante de español, ingreso per cápita, pobreza e índice de desarrollo humano (IDH). La tasa media nacional de contagios fue de 2 880/100 000 habitantes. Se aplicó la prueba T-test y, para determinar la fuerza de asociación entre la tasa de contagios y las variables, se aplicó la prueba de correlación de Pearson. Resultados Las entidades con menos tasa de población no hablante de español tuvo la menor tasa de contagios por COVID-19. El análisis de correlación mostró que los estados con tasas de contagio por COVID-19 por arriba de la media nacional tienen mejores condiciones de desarrollo. Discusión En nuestros resultados se revela una correlación negativa entre las tasas contagios por COVID-19 y la variable pertenecer a población indígena. Es necesario analizar desde la perspectiva de las comunidades las necesidades para afrontar escenarios de pandemia.

ABSTRACT Objective To analyze the impact between the social determinants in health and the rate of COVID-19 infection. Methods Quantitative ecological study at national and municipal levels. The main variables were COVID-19 infection rate, total non-Spanish-speaking population, per capita income, poverty, and human development index (HDI). The average national infection rate was 2 880/100 000 inhabitants. The T-test was applied, and Pearson's correlation test was performed to determine the strength of the association between the infection rate and the variables. Results Entities with the lowest rate of non-Spanish-speaking population had the lowest rate of COVID-19 infections. The correlation analysis showed that states with COVID-19 infection rates above the national average have better development conditions. Discussion Our results reveal a negative correlation between COVID-19 infection rates and the variable belonging to an indigenous population. It is necessary to analyze from the perspective of the communities the needs to face pandemic scenarios.

Detection of the Omicron variant of SARSCoV-2 by restriction analysis targeting the mutations K417N and N440K of the spike protein / Detección de la Variante Ómicron del SARS-CoV-2 por análisis de restricción de dos mutaciones de la proteína de la espiga

Abstract By the end of 2021, the Omicron variant of concern (VOC) emerges in South Africa. This variant caused immediate concern, due to the explosive increase in cases associated with it and the large number of mutations it exhibits. In this study, the restriction sites that allow detecting the mutations K417N and N440K in the Spike gene are described. This analysis allows us to propose a rapid method for the identification of cases infected with the Omicron variant. We show that the proposed methodology can contribute to provide more information on the prevalence and rapid detection of cases of this new VOC.

Resumen Para finales de 2021 surge la variante de preocupación (VOC por sus siglas en inglés) Ómicron en Sudáfrica. Esta variante causó de forma inmediata preocupación, debido al aumento explosivo de casos asociados a ella y al gran número de mutaciones que exhibe. En este estudio, se describen los sitios de restricción que permiten detectar dos de estas mutaciones en el gen de la espiga, las mutaciones K417N y N440K. Este análisis permite proponer un método rápido para la identificación de casos infectados con la variante Ómicron. Mostramos que la metodología propuesta puede contribuir a proporcionar más información sobre la prevalencia y a detectar rápidamente los casos de esta nueva VOC.

Gobernanza en el sistema de salud ante la pandemia por Covid-19 en México / Governance in health system in the face of the Covid-19 pandemic in Mexico

Resumen: Objetivo: Analizar la gobernanza en el sistema de salud en México, en las políticas frente a la pandemia por Covid-19. Material y métodos: Estudio cualitativo, analítico, realizado entre junio y noviembre de 2020. Se analizaron 41 entrevistas semiestructuradas que se aplicaron a actores clave del sistema de salud y que se organizaron en el software ATLAS.ti 9. El análisis se adhirió a los principios teórico-metodológicos del Marco Analítico de Gobernanza. Resultados: El problema: la formulación de políticas fue centralizada; los actores: sólo los altos mandos participan en las decisiones; las normas: los valores sociales y el liderazgo determinan su nivel de responsabilidad; toma de decisiones: los altos mandos reconocieron poder para proponer modificaciones al Marco Normativo; los nodos: las políticas federales fueron adaptadas a nivel estatal de manera diferenciada. Conclusiones: La gobernanza centralizada, los niveles diferenciados de convocatoria de los actores, su poder de decisión, acuerdos, responsabilidad y liderazgo, definieron el alcance de la gobernanza y, a su vez, el nivel de respuesta ante la pandemia por Covid-19.

Abstract: Objective: Analyze governance in the Mexican health system, with regards to policies to combat the Covid-19 pandemic. Materials and methods: Qualitative, analytic study carried out from June to November, 2020. Forty-one semi-structured interviews with key actors in the health system were analyzed and organized in ATLAS.ti-v.9 software. The analysis followed theoretical-methodological principles of the Governance Analytical Framework. Results: The problem: the policy-making was centralized; the actors: only high level actors participated in the decisions; decision-making: high level actors recognized power to propose modifications in the regulatory framework; nodes: federal policies were adapted at the state level in a differential manner. Conclusions: Centralized governance, differential levels of convocation of actors, decision-making power, level of agreements, as well as responsibility and leadership, all defined the reach of governance and, in turn, the level of response to the Covid-19 pandemic.

Out-of-pocket and catastrophic expenses in households of patients with schizophrenia lacking social security / Gastos de bolsillo y catastróficos en hogares de pacientes con esquizofrenia sin seguridad social

Abstract: Objective: To estimate the magnitude of out-of-pocket (OOP) and catastrophic health expenses as well as impoverishment experienced by households of schizophrenia patients lacking social security coverage. Materials and methods: We conducted a cross-sectional study of 96 individuals treated outpatient consultation between February and December 2018, in a psychiatric hospital. Results: All households sustained OOP health expenses; the median was 510 USD (95%CI: 456-628). The OOP expenses represented 28 and 4% of the capacity to pay of poor and rich households, respectively. The 16% of households incurred catastrophic expenses and 6.6% have impoverishment for health reasons. Conclusions: Our results illustrate that pocket expenses and catastrophic expenses in patients with schizophrenia are higher than those reported for the general population. Therefore, it is necessary to rethink the financial protection policies aimed at patients with schizophrenia and their households.

Resumen: Objetivo: Estimar la magnitud del gasto de bolsillo y catastrófico en salud, así como el empobrecimiento experimentado por hogares de pacientes con esquizofrenia que carecen de cobertura en seguridad social. Material y métodos: Se hizo un estudio transversal de 96 pacientes tratados en consulta externa entre febrero y diciembre de 2018, en un hospital psiquiátrico. Resultados: Todos los hogares soportaron gastos de bolsillo (GB), la mediana fue 510 USD (IC95%: 456-628). Los GB representan 28 y 4% de la capacidad de pago de los hogares pobres y ricos respectivamente. El 16% de los hogares incurrió en gastos catastróficos y 6.6% tiene empobrecimiento por motivos de salud. Conclusiones: Los resultados muestran que los gastos de bolsillo y gastos catastróficos en pacientes con esquizofrenia son mayores que los reportados para población general, por lo que es necesario repensar las políticas de protección financiera dirigidas a pacientes con esquizofrenia y sus hogares.

Cost-effectiveness analysis of interventions to achieve universal health coverage for schizophrenia in Mexico / Análisis costo-efectividad de las intervenciones para alcanzar la cobertura universal en salud para esquizofrenia en México

Abstract Introduction To achieve universal coverage in mental health, it is necessary to demonstrate which interventions should be adopted. Objective Analyze the alternatives of pharmacological and psychosocial treatment in Mexico for patients diagnosed with schizophrenia, as well as Early Intervention in Psychosis Program. Method The Extended cost effectiveness analysis (ECEA), it is implemented under scenario the option of treatment in Mexico, which includes: typical or atypical antipsychotic medication plus psychosocial treatment, assuming that all the medications will be provided to the patient, a measure of effectiveness is the years of life adjusted to disability (DALYs). Results The effect of Universal Public Financing (UPF) is reflected in avoiding 147 DALYs for every 1,000,000 habitants. In addition, has a positive effect in the avoided pocket expenditures from US $ 101,221 to US $ 787,498 according to the type of intervention. Increasing government spending has a greater impact on the poorest quintile, as a distributive effect of the budget is generated. Respect to the value of insurance, the quintile III is the one who is most willing to pay for having insurance, on the other hand, in the highest income quintile, the minimum assurance valuation was observed. Discussion and conclusion The reduction in out-of-pocket spending is uniform across all quintiles; "Early Intervention in Psychosis Program" is not viable for middle income countries, as México. The ECEA is a convenient method to assess the feasibility and affordability of mental health interventions to generate information for decision makers.

Resumen Introducción Para lograr la cobertura universal en salud mental es necesario demostrar qué intervenciones deberían ser adoptadas. Objetivo Analizar las alternativas de tratamiento farmacológico y psicosocial para pacientes con esquizofrenia incluidas, así como un Programa de Intervención Temprana en Psicosis. Método El análisis costo efectividad extendido (ECEA) se implementó bajo un escenario que incluye: medicación antipsicótica típica o atípica más tratamiento psicosocial, asumiendo que todos los medicamentos serán provistos a los pacientes, la medición de la efectividad en términos de DALYs. Resultados El efecto del financiamiento público universal se refleja en evitar 147 DALYs por cada 1, 000,000 de habitantes. Además, tiene un efecto positivo en evitar pagos de bolsillo de US $ 101,221 a US $ 787,478 de acuerdo con el tipo de intervención. Incrementar el gasto del gobierno tiene un gran impacto sobre los quintiles más pobres como efecto distributivo del presupuesto. El quintil III de ingreso tiene mayor disposición a pagar el aseguramiento mientras que el quintil más rico tiene menor disposición a pagarlo. Discusión y conclusión La reducción de los gastos de bolsillo es uniforme en todos los quintiles de ingreso, pero el "Programa de Intervención Temprana en Psicosis" no es viable generalizarlo para países de ingreso medio, como México. El ECEA es un método conveniente para evaluar la factibilidad y asequibilidad de intervenciones en salud mental para generar información para los tomadores de decisiones.

Necesidades de atención en salud mental y uso de servicios en población mexicana con trastornos mentales graves / Mental health care needs and use of services in Mexican population with serious mental disorders

Resumen: Objetivo: Analizar las demandas de atención de los trastornos mentales graves (TMG) y factores asociados con la utilización de servicios en México. Material y métodos: Se llevó a cabo un estudio analítico transversal en dos fases: la primera con una base de datos nacional de servicios disponibles y su utilización; la segunda, una muestra de registros médicos de un hospital psiquiátrico. Resultados: La esquizofrenia es el TMG más prevalente; más de 50% de hospitalizados fueron hombres, con edad promedio 37 años. La utilización de servicios estuvo asociada con la edad (β=1.062; p=.000), ingreso familiar (β=1.000, p=.000) y no tener ocupación (β=3.407; p=.000). La población con esquizofrenia tiene cuatro veces más la probabilidad de requerir estar exenta de pago (β=4.158; p=.000). Conclusiones: La población con TMG es más vulnerable por la discapacidad funcional y social asociada; requiere de intervenciones específicas de salud acompañadas de una política de protección financiera adaptada a sus necesidades de atención.

Abstract: Objective: To analyze the mental health care needs of the serious mental disorders (SMD) and factors associated with the use of services in Mexico. Materials and methods: A cross-sectional analytical study was conducted in two phases, the first with a national database of available services and its utilization; the second, a sample of medical records of a psychiatric hospital. Results: Schizophrenia is the most prevalent MDS; more than 50% of those hospitalized were male, with an average age of 37 years. The use of services was associated with age (β=1.062, p=.000), family income (β=1.000, p=.000) and no laboral occupation (β=3.407, p=.000). The population with schizophrenia is four times more likely to require to be exempt from payment (β=4.158, p=.000). Conclusions: The population with SMD as schizophrenia is more vulnerable due to the associated functional and social disability and it requires specific heath interventions and a financial protection policy adapted to their mental health care needs.

Análisis de costos de atención médica para esquizofrenia y depresión en México para el periodo 2005-2013 / Cost analyses of medical care for schizophrenia and depression in México, 2005-2013 / Análises de custos da atenção médica para esquizofrenia e depressão no México no período de 2005-2013

El objetivo fue identificar los costos de la atención para enfermedades de salud mental en el sistema de salud de México. Se trata de una investigación evaluativa de tipo transversal retrospectivo. Se seleccionaron como trazadores del problema dos de las principales demandas de salud mental en los últimos años: depresión y esquizofrenia. La incidencia acumulada anual se identificó a partir del reporte epidemiológico por tipo de institución para el periodo 2005-2013. El costo del manejo anual de caso promedio se determinó a partir de la técnica de instrumentación y consenso, identificando las funciones de producción, el tipo de insumos, los costos y cantidad de insumos requeridos, concentrados en la matriz de caso promedio. Finalmente, se aplicó un factor de ajuste econométrico para controlar efecto inflacionario para cada año del periodo de estudio. El costo promedio del manejo anual de un caso en dólares americanos para esquizofrenia fue de 2.216,00 y para depresión 2.456,00. Para todas las instituciones del sistema de salud se observan tendencias epidemiológicas y económicas crecientes y constantes. El costo total para ambas enfermedades para el último año del periodo (2013) fue de USD 39.081.234,00, USD 18.119.877,00 para esquizofrenia y USD 20.961.357,00 para depresión. El mayor impacto para ambas enfermedades está en las instituciones para población no asegurada (USD 24.852.321,00) vs. población asegurada (USD 12.891.977,00). El costo de satisfacer la demanda de servicios para ambas enfermedades difiere considerablemente entre las instituciones que se ocupan de la población asegurada vs. población no asegurada, siendo mayor el de las segundas. Los indicadores epidemiológicos y económicos de este estudio contribuyen a la generación de evidencias para tomar decisiones en el uso y asignación de recursos para los servicios de salud que demandarán ambas enfermedades en los próximos años.

The study aimed to analyze the costs of medical care for mental disorders in the Mexican health system. This was a retrospective cross-sectional evaluation study. As markers for the problem, the study selected two of the principal psychological processes in mental disorders in recent years: depression and schizophrenia. Annual accumulated incidence was identified based on epidemiological reporting by type of institution in 2005-2013. The mean annual case management cost was determined with the instrumentation and consensus technique, identifying the production functions, types of inputs, costs, and amounts of inputs ordered, concentrated in the mean case matrix. Finally, an econometric adjustment factor was applied to control the inflationary effect for each year in the study period. Mean annual case management cost was USD 2,216.00 for schizophrenia and USD 2,456.00 for depression. All the institutions in the Mexican health system showed upward and constant epidemiological and economic trends. The total cost for the two disorders in the last year of the period (2013) was USD 39,081,234.00 (USD 18,119,877.00 for schizophrenia and USD 20,961,357.00 for depression). The largest impact for the two disorders combined was in institutions serving the population without health insurance (USD 24,852,321.00) versus the population with private insurance (USD 12,891,977.00). The cost of meeting the demand for services for the two disorders differs considerably between institutions that treat the population with private health service versus the population without, and is higher in the latter. The study's epidemiological and economic indicators provide evidence for decision-making in the use and allocation of healthcare resources for these two disorders in the coming years.

O trabalho teve como objetivo identificar os custos na atenção médica para doenças mentais no sistema de saúde no México. Trata-se de uma pesquisa de avaliação de tipo transversal retrospectiva. Foram selecionados como marcadores do problema dois dos principais processos psíquicos de doenças mentais nos últimos anos: depressão e esquizofrenia. A incidência acumulada anualmente foi identificada a partir do relatório epidemiológico por tipo de instituição no período de 2005-2013. O custo médio da gestão anual de caso foi determinado a partir da técnica de instrumentação e consenso, identificando-se as funções de produção, o tipo de insumos, os custos e quantidade de insumos solicitados, concentrados na matriz de caso médio. Por fim, foi aplicado um fator de ajuste econométrico para controlar o efeito inflacionário para cada ano do período de estudo. O custo médio da gestão anual de um caso em dólares americanos para esquizofrenia foi de 2.216,00 e para depressão 2.456,00. Para todas as instituições do sistema de saúde observam-se tendências epidemiológicas e econômicas crescentes e constantes. O custo total para ambas as doenças no último ano do período (2013) foi de USD 39.081.234,00 - USD 18.119.877,00 para esquizofrenia e USD 20.961.357,00 para depressão. O maior impacto para ambas as doenças encontra-se nas instituições para população sem seguro médico (USD 24.852.321,00) vs. população com seguro privado (USD 12.891.977,00). O custo a fim de poder satisfazer a demanda dos serviços para as duas doenças é diferente consideravelmente entre as instituições que se ocupam da população com seguro médico privado vs. população sem seguro médico, sendo maior o das segundas. Os indicadores epidemiológicos e econômicos deste estudo contribuem para a geração de evidências para a tomada de decisões no uso e atribuição dos recursos orientados aos serviços de saúde que vão ser demandados por causa das duas doenças nos próximos anos.

Las pruebas de ADN en el contexto forense parte II. Interpretación estadística / Basic concepts of DNA testing in the forensic context part II. Statistical interpretation

Este artículo expone los conceptos básicos de las pruebas de ADN en el contexto forense. Describe como se establece la coincidencia entre el perfil genético de la muestra biológica encontrado en la escena del crimen con el perfil de un sospechoso o imputado; como se estima la probabilidad de que la coincidencia haya sido por azar evaluando la frecuencia del perfil genético en la población, es decir, la probabilidad de que el sospechoso en realidad no haya sido la fuente de la evidencia; y otros parámetros estadísticos importantes al momento de evaluar un análisis de ADN...(AU)

Caracterización molecular del virus de la Hepatitis C en pacientes remitidos al Laboratorio Regional de Salud Pública del Hospital Universitario “Antonio Patricio de Alcalá”, Cumaná, Venezuela / Molecular characterization of hepatitis C virus in patients referred to a reference laboratory of public health, University Hospital “Antonio Patricio de Alcalá”, Cumaná, Venezuela

La Organización Mundial de la Salud estima que aproximadamente 170 millones de personas están crónicamente infectadas por el virus de la hepatitis C (VHC). En este estudio se evaluó la presencia de anticuerpos contra el VHC en pacientes remitidos durante enero de 2010 a febrero de 2013, al Laboratorio Regional de Salud Pública del Hospital Universitario “Antonio Patricio de Alcalᔠen Cumaná, Venezuela. La presencia de anticuerpos se hizo mediante dos ensayos de ELISA y se determinaron los genotipos circulantes a través de análisis filogenéticos de fragmentos de genoma viral amplificados por la región 5’ no codificante (5’NC) y región no estructural 5b (NS5b) usando la transcripción reversa y reacción en cadena de la polimerasa en dos rondas (RT-PCR). Se encontró una prevalencia de anticuerpos contra el VHC del 0,57 % (17/3005), siendo el grupo etario mayor de 41 años el más afectado (0,9 %). Un total de 16 muestras resultaron positivas para la presencia del ARN viral por RT-PCR en la región 5´NC (16/17, 94 %). El análisis filogenético de la región 5´NC permitió identificar la circulación del genotipo 2 y 1 y de un genotipo 3 y uno 4. Mediante análisis filogenéticos de la región NS5b, se observó la presencia de diversos subtipos dentro del genotipo 2 (2a, 2j y 2s), lo que concuerda con estudios anteriores que muestran que este genotipo es relativamente diverso en nuestro país.

The World Health Organization estimates that approximately 170 million people are chronically infected with hepatitis C virus (HCV). This study evaluated the presence of antibodies against HCV by two immunoassays. HCV genotypes were analyzed by phylogenetic analysis of viral genome fragments amplified from the 5 ‘non-coding (5’NC) region and non-structural region 5b (NS5b), using reverse transcription and nested polymerase chain reaction (RT-PCR), in patients referred from January 2010 to February 2013 to the Reference Laboratory of Public Health, University Hospital “Antonio Patricio de Alcalá”. The prevalence of anti-HCV antibodies was 0.57% (17/3005), being the group of patients older than 41 years the most affected (0.9%). A total of 16 samples were found positive for HCV RNA by RT-PCR in the 5’NC region (16/17, 94%). Phylogenetic analysis of the 5´NC region allowed to identify the circulation of genotypes 2 and 1, and one genotype 3 and one 4. By phylogenetic analysis of the NS5b region, diverse subtypes of HCV genotype 2 were identified (2a, 2j and 2s). This finding is in accordance with previous studies that indicate that this genotype is relatively diverse in our country.

Infección por el virus de la hepatitis C (HCV) en pacientes hemodializados seronegativos para anticuerpos anti-HCV / Hepatitis C virus (HCV) infection in hemodialysed patients seronegative for anti-HCV antibodies

La infección por el virus de la hepatitis C (HCV) es común en pacientes hemodializados. Se evaluaron 43 sueros de pacientes de la Unidad de Diálisis “Dr. José Maza Carvajal” del Servicio Autónomo del Hospital Universitario “Antonio Patricio de Alcalᔠ(SAHUAPA), en Cumaná, estado Sucre. Se determinaron anticuerpos IgG séricos contra el HCV (anti-HCV) utilizando tres técnicas inmunoenzimáticas. Para amplificar la región 5’ no codificante (5’NC) se usó la técnica de transcripción reversa de la reacción en cadena de la polimerasa (RT-PCR), en muestras positivas y negativas para anti-HCV. La presencia de anticuerpos y RNA del HCV fue de 9,3% y la presencia de RNA del HCV en pacientes con anti-HCV negativos fue de 42%, lo cual representó una frecuencia de infección activa de 51%. Análisis filogenéticos de la región 5’NC evidenciaron que el genotipo 2 fue el más prevalente, en particular el subtipo 2b, seguido por el genotipo 1, mientras que en siete muestras no se logró identificar el subtipo. La presencia de un alto número de pacientes seronegativos e infectados con el HCV puede deberse al estado de inmunocompromiso de estos pacientes; de allí la importancia de la determinación de la viremia.

Hepatitis C virus infection is common in hemodialysed patients. Sera from 43 patients from the Dialysis Unit “Dr. José Maza Carvajal” of the University Hospital “Antonio Patricio de Alcalá”, in Cumana, Sucre state, were evaluated. Antibodies against HCV (anti-HCV) were determined using three immunosorbent assays. The 5 ‘non-coding (5’NC) HCV region was amplified by RT-PCR in all samples. The presence of antibodies and HCV RNA was 9.3% and of HCV RNA in seronegative sera 42%, which represents a frequency of infection of 51%. Phylogenetic analysis of the 5’NC region showed that genotype 2 was the most frequently found, particularly due to subtype 2b, followed by genotype 1, while seven subtypes could not be determined. The presence of a high number of seronegative HCV-infected hemodialysed patients might be due to the immunocompromised condition of these patients; hence the importance of determining the viremia.

Optimización de la técnica de PCR reversa para la detección del VIH en plasma de pacientes infectados / Optimization of the reverse PCR technique for HIV detection in plasma of infected patients

Aunque la técnica convencional para el diagnóstico del VIH es la PCR a partir de ADN proviral, la técnica RT-PCR cualitativa podría constituir una herramienta de apoyo en el diagnóstico del VIH en pacientes infectados, ya que una de sus principales ventajas es el uso de muestras de plasma, en lugar de sangre total, lo cual facilitaría su transporte entre las distintas regiones del país. En este estudio se planteó como objetivo evaluar las condiciones óptimas, en cuanto al uso de cebadores y enzima transcriptasa reversa, para síntesis de ADN complementario (RT-PCR) de la región de envoltura del VIH, a partir de muestras de plasma de pacientes VIH positivos. Los resultados obtenidos en este trabajo sugieren que la utilización de cebadores azarosos, en una mezcla de reacción con la enzima RT “SuperScript” TM (200 U/mL), permite maximizar la eficiencia de amplificación del gen de la envoltura de VIH-1, en comparación con cebadores específicos. Esto permite ofrecer una alternativa metodológica a partir de muestras de plasma, para la detección del VIH en aquellas personas que por diversas razones no pueden trasladarse a la institución de referencia.

Even though PCR is the conventional technique for HIV diagnosis in proviral DNA, the qualitative RT-PCR technique could constitute a support tool for HIV diagnosis in infected patients since one of its main advantages is the use of plasma samples instead of whole blood, which facilitates its transportation from the various regions of the country. The main objective of this study was the evaluation of the optimal conditions regarding use of primers and reverse transcriptase enzyme, for the synthesis of complementary DNA (RT-PCR) of the HIV sheath in plasma samples of HIV positive patients. The results obtained in this study suggest that the use of random primers, in a reactive mixture with the RT “SuperScript” enzyme TM (200 U/mL), allows maximizing the amplifying efficiency of the HIV-1 sheath gene, as compared with specific primers. This offers a methodological alternative using plasma samples for HIV detection in those persons who due to various reasons cannot travel to the reference institution.

Costo-efectividad de intervenciones para esquizofrenia en México / Cost effectiveness of interventions for schizophrenia in Mexico

The World Health Organization estimates that the expense of attending mental illness problems in developed countries amounts to 3-4% out of the total GDP. The public expense for hospitalization of patients diagnosed with schizophrenia was three times higher in patients who decide to leave the treatment than those who continue with it; ambulatory patients amount to almost the same figures in public expenses whether they decide to continue the treatment or not. In the USA, there are 87 000 people hospitalized due to schizophrenia every year, which represent 93 000 hospital days with a cost of about 806 billion dollars a year; to stop patients from leaving the treatment, however, would cut the number of acute cases 12.3% and hospitalizations 13.1%. These two reductions would cut down the expenses in Medicaid as much as 106 million dollars. According to data gathered by the Organization for the Economical Cooperation and Development for Germany, the expense in mental health accounts for 10% of total health expenses, being schizophrenia, depression and anxiety the most costly illnesses. Finland doubled the expenses to attend those who suffered mental illnesses between 1990 and 2003. The total annual expenses for the treatment of schizophrenia in Latin American and Caribbean countries accounts for 1.81%, for Africa 0.47%, for Europe 1.32% and for southern Asia 0.52 in millions of dollars per every million people. In Mexico, a first estimate, based on the demand and the amount of money destined to attend this problem by every health institution, it was concluded that the average annual expenses in medical attention for schizophrenia was US97.54 per person. The Health Sector reports that the cost for a psychiatric evaluation or psychotherapy amounts to US1.42 and the estimated annual cost for the treatment of schizophrenia in a public institution amounts to somewhere between US60.34 and US2,1 86.83; all this would depend on the haloperidol or clozapine drug. In a private institution, the cost for a psychiatric evaluation is US63.44 and the annual estimated cost is somewhere between US1,695.79 and US5,988.58 including treatments with the aforementioned drugs. The cost-effectiveness analysis is a method which indentifies, quantifies and values the expenses of two or more alternatives of sanitary intervention available at the time to reach certain objectives. This will be possible as long as the effects are channeled to the same class of effects. The measure of the analysis summary concerning cost-effectiveness is the ratio cost-effectiveness which allows comparison of different action alternatives, identifying two types of indicators: average cost and increased cost. Regarding the methodological procedures, the research project was based in a length and descriptive study, though not statistical. It was designed to carry out an analysis of cost-effectiveness in the alternatives of treatment for patients who were diagnosed with schizophrenia at the Fray Bernardino Psychiatric Hospital. This study allowed the identification and quantification of costs of the demand, the treatment, hospitalization, and the ambulatory services. The effectiveness of the alternatives in treatment studied is measured in terms of the readmitted. Four non-statistical samples were taken of clinical files out of each studied service. External Consultation: 50 clinical files, 15 were discarded for not being diagnosed with schizophrenia; the other 35 were followed and analyzed for six months. Day Hospital: 65 files of the total of patients diagnosed with schizophrenia, 12 were discarded for being diagnosed differently. Therapeutic clinical adherence (TAC): a sample of 85 files of patients diagnosed with schizophrenia was taken. Patients with membership to ISSSTE diagnosed with schizophrenia who came out of hospitalization between June-October 2008 were followed during a period of six months in order to measure the readmitted to hospitalization; 67 patients were registered. The costs of personnel (doctor, nurses, social service, and psychology and hygiene staff) were obtained out of the coefficient of the total annual salary between the annual working day in minutes for the time destined to attention of each patient. The costs for catering and laundry were calculated directly. The laboratory cost was obtained taking into account cost-time destined to the study of administrative personnel, technicians and supervision, as well as materials and the necessary equipment. The indirect costs (security, hygiene, water, electric power, and municipal and biological waste) were obtained dividing the total annual costs in the average annual number of patients who needed hospitalization; this was done taking into account that the daily average in occupation is 296 patients. The external consultation was excluded for being deemed unimportant in terms of consumption. Analysis: descriptive statistics. Cost-effectiveness analysis. With respect to the main findings, the hospitalization costs are: emergency room US136.00, intensive care US1 62.72, and continuous hospitalization US68.83. The cost of day hospital is US34.57, US68.91 in TAC and external consultation US9.67. The semester consultation for patients undergoing external consultation, day hospital and TAC received 2.3, 23.5 and 7.5 each one. The readmitted in ambulatory services are 8.5%, 7.5%, and 5.8% for external consultation, day hospital, and TAC. The hospitalization days for patients who were readmitted due to an increase in symptoms was 42.5, 1 2.5, and 25 days in average for external consultation, day hospital and TAC. The effectiveness coefficient indicates that avoiding a readmitted to external consultation, day hospital, TAC and external consultation at ISSSTE amounted to US15.26, US518.84, US499.23 and US16.37 accordingly. The cost of making use of an additional hospital unit during the day is US 1321.41; it amounts to US11 66.31 for therapeutic care and US1 7.79 at ISSSTE. According to the main results, the costs for medical attention through the system of cascade primary costs differ too much when compared to the unitary costs published in the Diario Oficial; the ambulatory costs are very different in terms of costs but they show very similar results. The difference between the costs for attending patients diagnosed with schizophrenia is due to the number of patients and the personnel assigned to the area. These results are influenced by the number of semester consultations: 23.5 times in day care hospitalization against the 7.5 and 2.3 times in average of TAC and external consultation accordingly. The average rate of avoided readmitted is low in external consultation compared to the other three alternatives; this rate is affected by the largest number of people who abandoned TAC, which could empirically be explained by the need of the patient to buy his medication. Upon making a comparison of the costs of the alternatives of integral treatment for schizophrenia in the Fray Bernardino Psychiatric Hospital, we found that the average cost for external consultation is much clearer in terms of cost-effectiveness than day hospital and TAC; this means that the first option is much more effective and less money is required than the other two. Even though external consultation registers a very high rate of abandonment in terms of treatment by the patients, it still shows to be more effective. It is also slightly more effective than external consultation at ISSSTE; this is to say that if we only consider the effectiveness based on how much we avoid readmitted, it would be much more appropriate for patients who attend external consultation to be given the necessary medication and in doing so reducing the costs of day care hospitalization and TAC. The increased cost shows that avoiding an admitted to day hospital results in a cost of about US1321.41 which is almost the same as readmitted a patient attending external consultation whose symptoms have become more acute, and much more expensive than the total cost of attending that patient in that service over six months. The cost for avoiding a readmitted in TAC is US1166.31 whereas the cost for avoiding a readmitted in ISSSTE is US1 7.79 the strategy should be targeted to providing the necessary medication for patients who are attending external consultation.

La Organización Mundial de la Salud estima que el gasto por la atención de los problemas de salud mental en países desarrollados corresponde a 3-4% del PIB. La Organización para la Cooperación y Desarrollo Económico reporta que, en la Unión Europea, 25% de los gastos en discapacidad se destinan a las ocasionadas por enfermedad mental. El costo anual total de la esquizofrenia para países de Latinoamérica y el Caribe es de 1.81, para África 0.47, para Europa 1.32 y para el Sur de Asia 0.52 en millones de dólares por millón de personas. En México, en una primera aproximación se concluyó que el costo anual promedio de atención médica de la esquizofrenia es de $1,230. En este contexto, se desarrolló un análisis de costo-efectividad de las tres alternativas de tratamiento de pacientes con diagnóstico de esquizofrenia. Respecto a los principales procedimientos metodológicos, el proyecto se basó en un estudio longitudinal y descriptivo. Se usaron cuatro grupos de expedientes clínicos de cada uno de los servicios estudiados. La efectividad de los tratamientos proporcionados se midió en términos de los reingresos a hospitalización en el periodo estudiado. Los costos calculados: personal, lavandería, alimentos, laboratorio, seguridad, limpieza, agua, energía eléctrica y residuos municipales y biológicos. Análisis costo-efectividad. Entre los principales resultados se encontraron los siguientes: Costo hospitalización: día/paciente en urgencias $1,715.00, en cuidados intensivos $2,052.00, y en hospitalización continua $868.00. El costo diario en hospital de día es de $436.00, en Clínica de Adherencia Terapéutica (CAT) $869.00 y en consulta externa $122.00 por consulta. Las consultas semestrales en consulta externa, hospital de día y CAT recibieron 2.3, 23.5 y 7.5, respectivamente. Los días de hospitalización de los pacientes que reingresaron por exacerbación de síntomas fueron 42.5, 12.5 y 25 en promedio para consulta externa, hospital de día y CAT, respectivamente. Reingresos 8.5, 7.5 y 5.8% para consulta externa, hospital de día y clínica de adherencia terapéutica, respectivamente. El coeficiente de efectividad para consulta externa, hospital de día, CAT y consulta externa del ISSSTE, es de $192.50, $6,542.60, $6,295.30 y $206.50, respectivamente. El costo de producir una unidad adicional en hospital de día es de $1 6,663; en clínica de adherencia terapéutica $ 14,707.20 y en el ISSSTE $224.40. A partir de estos resultados, el artículo retoma los principales hallazgos resaltando los indicadores de costo, de efectividad y del coeficiente costo-efectividad para cada intervención. Los costos de atención médica a través del sistema empleado en el presente documento difieren demasiado de los costos unitarios publicados en el Diario Oficial de la Federación. Los servicios ambulatorios son muy dispares en cuanto a costo pero de resultados similares, influidos por el número de consultas semestrales, 23.5 veces en hospital de día, contra las 7.5 y 2.3 veces en promedio de CAT y consulta externa, respectivamente. La tasa de reingresos evitados es baja en consulta externa respecto a las otras tres alternativas, afectada por el mayor abandono terapéutico atribuido empíricamente a la necesidad del paciente de comprar su medicación. Consulta externa es más costo-efectiva que hospital de día y CAT, esto es, con menos recursos es más efectiva que las otras dos, aun con elevado abandono de tratamiento; sólo considerando la efectividad en términos de evitar reingresos, convendría proporcionarles los medicamentos que requieran a pacientes que acuden a consulta externa, reduciendo los recursos destinados a hospital de día y CAT. Finalmente, es importante resaltar que el costo incremental muestra que evitar un ingreso en hospital de día genera un costo de $1 6,663.00 casi igual al costo de un internamiento; evitar un ingreso en CAT es de $14,707.00 mientras que el costo de evitar un reingreso en el ISSSTE es $224.40. La estrategia debería encaminarse a otorgar los medicamentos en consulta externa.

Prevalence of antiretroviral drug resistance among treatment-naive and treated HIV-infected patients in Venezuela

An in-house, low-cost method was developed to determine the genotypic resistance of immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) isolates. All 179 Venezuelan isolates analysed belonged to subtype B. Primary drug resistance mutations were found in 11 percent of 63 treatment-naïve patients. The prevalence of resistance in isolates from 116 HIV-positive patients under antiretroviral treatment was 47 percent to protease inhibitors, 65 percent to nucleoside inhibitors and 38 percent to non-nucleoside inhibitors, respectively. Around 50 percent of patients in the study harboured viruses with highly reduced susceptibility to the three classical types of drugs after only five years from their initial diagnoses.

Diversidad genética del virus de inmunodeficiencia humana en las américas, con énfasis en la epidemia venezolana / Genetic diversity of human immunodeficiency virus in the americas, with emphasis on the venezuelan epidemics / Diversidade genética do vírus da imuodeficiência humana nas américas, com enfase na epidemia venezuelana

Alrededor de 3 millones de personas están infectadas con el virus de inmunodeficiencia humana (VIH) en las Américas y unas 110000 en Venezuela, donde la distribución de subtipos es bastante homogénea, representada principalmente por el subtipo B y una escasa representación de subtipos no B y/o formas recombinantes. El predominio del subtipo B en las Américas quizá se deba al efecto fundador de esta variante viral en los años 1960-1970, siendo Haití uno de los países donde pudo haberse iniciado la epidemia para luego diseminarse hacia otros países. El incremento en la frecuencia de subtipos no B en las Américas ha sido asociado a varios comportamientos de riesgo: el uso de drogas endovenosas, el comercio sexual y movilizaciones sanitarias o militares. En países como Cuba, Brasil y en países del Cono Sur la presencia de subtipos no B y de formas recombinantes es mayor que en el resto de la región. Esta situación pudiera ser el espejo de lo que encontremos en todo el continente americano en décadas futuras.

Around 3 million people are thought to be infected with human immunodeficiency virus (HIV) in the Americas, and around 110000 in Venezuela, where HIV subtype distribution is quite homogenous, with mainly subtype B and few cases of non B subtypes or recombinant forms. The high frequency of subtype B in the Americas is probably due to a founder effect of this viral variant around 1960-1970. The epidemic might have started in Haiti and then was disseminated to other countries. The increase in frequency of non B subtypes in the Americas has been associated to several risk factors: intravenous drug abuse, commercial sex and sanitary and military movilizations. In countries like Cuba, Brasil and countries from the Southern Cone, the presence of non B subtype and recombinant forms is more frequent than in the rest of the region. This situation might mirror what we will find in all the Americas in the next decades.

É estimado em mais de 3 milhões de pessoas infectadas com o vírus da imunodeficiência humana tipo 1 (HIV-1) nas Américas e cerca de 110000 na Venezuela, onde a distribuição dos subtipos é bastante homogênea, representada principalmente pelo subtipo B e uma baixa representação de subtipos não-B e / ou formas recombinates. O predomínio do subtipo B nas Américas pode ser devido ao efeito fundador desta variante viral nos anos 1960-1970, sendo o Haiti um dos países onde a epidemia pode ter começado, disseminando-se para outros países. O aumento na freqüência de subtipos não-B nas Américas tem sido associada a vários comportamentos de risco: uso de drogas endovenosas, comércio sexual e sanitário e mobilizações militares. Em países como Cuba, Brasil e países do Cone Sul, a presença de subtipos não B e formas recombinates é maior do que nas demais regiões. Esta situação poderá ser o espelho do que encontraremos em todo o continente americano nas futuras décadas.

Evaluación de alimentos integrales para el engorde intensivo de ovinos / Evaluation of complete feeds for intensive fattening lambs

Se realizó una evaluación de 4 alimentos comerciales para el engorde intensivo de ovinos en México, con diferentes composiciones de nutrientes. Se determinó la concentración de almidón y se estimaron las fracciones de proteína digestible en intestino (PDI). Se usaron 20 borregos machos criollos x Suffolk, con peso vivo inicial de 25,28 ± 5,7 kg en jaulas metabólicas individuales para evaluar consumo de materia seca (CMS), ganancia de peso (GDP) y conversión (CA), durante 45 días. Los alimentos (tratamientos) evaluados fueron: T1=Albapesa; T2=Purina; T3=Union Tepexpan; y T4=Hacienda. No se encontraron diferencias (P>0,05) en el CMS g/d (T1 1316; T2 1201; T3, 1124; T4 1093), GDP g/d (T1 260; T2 216; T3 285; T4 202), y CA (T1 5,05; T2 5,56; T3 3,94; T4 5,39). La estimación de la ganancia de peso basado en la digestibilidad in situ de la MS y en las ecuaciones del NRC permitieron predecir en forma adecuada el comportamiento de ovinos (r²=0,79). A pesar de que no hubo diferencias en el comportamiento, los costos de alimentación y los beneficios económicos fueron diferentes.

An evaluation of 4 commercial concentrates for intensive fattening of sheep was conducted in Mexico. Starch content was determined and protein digestible in small intestine (PDI) fractions were estimated. Twenty male sheep (criollo x Suffolk) with initial weight 25.28 ± 5.7 kg were allotted in individual crates to evaluate dry matter intake (DMI), weight gain (ADG) and feed conversion ratio (FC), during 45 days. Feed (treatments) evaluated were: T1=Albapesa; T2=Purina; T3=Union Tepexpan; and T4=Hacienda. No differences were found (P>0.05) in DMI g/d (T1 1316; T2 1201; T3, 1124; T4 1093), AGD g/d (T1 260; T2 216; T3 285; T4 202), FC (T1 5.05; T2 5.56; T3 3.94; T4 5.39). Estimation of gain based on in situ DM digestion and NRC equations allow the adequate prediction of sheep performance (r²=0.79). Despite of the lack of difference in performance, feed costs and economic benefits were different.

High prevalence of secondary resistance mutations in Venezuelan HIV-1 isolates

Se estudiaron pacientes seropositivos para el virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 (VIH-1) con y sin tratamiento, con el fin de determinar el polimorfismo y la prevalencia de mutaciones de resistencia a la terapia antirretroviral. El material genético viral fue extraído a partir de células mononucleares de sangre periféricas (ADN) y del plasma (ARN) de 30 pacientes. Se amplificaron 2 regiones del gen Pol, Transcriptasa Reversa (TR) y Proteasa (Pr) y el gen de envoltura (Env) por medio de la técnica de PCR y se obtuvo la secuencia genómica de los productos. Todos los aislados analizados pertenecieron al subtipo B. No se observaron mutaciones primarias asociadas a resistencia a inhibidores de Pr pero sí un alto porcentaje (86 por ciento, 19/22) de mutaciones no asociadas con resistencia sino a restitución de la capacidad replicativa de cepas mutantes (mutaciones secundarias). Se observó la presencia de mutaciones asociadas a resistencia a inhibidores nucleósidos de la TR (INTR) en 35 por ciento (6/17) de los pacientes sometidos a tratamiento, mientras que 12 por ciento (2/17) de ellos presentaron mutaciones de resistencia a inhibidores no nucleósidos de la TR (INNTR). Interesantemente, un paciente no tratado estaba infectado con una cepa que presentaba mutaciones primarias (7,7 por ciento); este resultado sugiere que podría ser importante plantearse el estudio local de determinación de resistencia genotípica en pacientes antes del tratamiento, con miras a minimizar fallas terapéuticas. Se requieren estudios adicionales para evaluar el rol de las mutaciones secundarias en el éxito de la infección viral